A síndrome afeta o desenvolvimento neurológico, e pode estar associada a uma ampla gama de sintomas, incluindo atraso global do desenvolvimento (moderado a grave), atraso ou ausência de fala, alta tolerância à dor, perturbação do espectro do autismo, epilepsia e diversas outras manifestações, as quais dependem em grande parte do tipo e extensão (1) da alteração no cromossoma 22 (que pode envolver múltiplos genes) ou (2) da variante do gene SHANK3.